Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HIGD1BQ9P298 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms