Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHRF1Q9P1Y6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms