Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EHD3Q9NZN3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EHD3Q9NZN3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms