Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C9orf78Q9NZ63 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms