Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A12Q9NXJ0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms