Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PARVAQ9NVD7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PARVAQ9NVD7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms