Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SPTLC3Q9NUV7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPTLC3Q9NUV7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms