Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMBRD1Q9NUN5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms