Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMC4Q9NTJ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMC4Q9NTJ3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms