Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KCNIP2Q9NS61 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNIP2Q9NS61 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms