Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms