Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMCO4Q9NRQ5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms