Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KIAA1549Q9HCM3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms