Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USP29Q9HBJ7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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