Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EFCC1Q9HA90 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFCC1Q9HA90 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms