Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms