Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF41Q9H4P4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms