Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EHD4Q9H223 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms