Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT23Q9C075 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms