Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms