Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDEM3Q9BZQ6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDEM3Q9BZQ6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms