Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPF3BQ9BZI7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms