Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM54Q9BYV2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM54Q9BYV2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms