Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SNHG12Q9BXW3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms