Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VN1R3Q9BXE9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VN1R3Q9BXE9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms