Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPAP1Q9BWH6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPAP1Q9BWH6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms