Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDC1Q9BTX1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms