Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM43Q9BTV4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms