Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SHANK2-AS3Q9BTD1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SHANK2-AS3Q9BTD1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SHANK2-AS3Q9BTD1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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