Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN18Q99952 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms