Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRG3Q99928 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms