Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP88Q99567 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP88Q99567 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms