Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms