Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF13CQ96RJ3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF13CQ96RJ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF13CQ96RJ3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF13CQ96RJ3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFRSF13CQ96RJ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms