Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CIB3Q96Q77 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CIB3Q96Q77 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms