Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMG1Q96Q15 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms