Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF396Q96N95 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF396Q96N95 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms