Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC43Q96MW1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms