Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP44Q96MT7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP44Q96MT7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms