Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC7Q96M83 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC7Q96M83 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms