Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC114Q96M63 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC114Q96M63 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms