Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRRC1Q96M27 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms