Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM47Q96LD4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms