Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR3Q96KR7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR3Q96KR7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms