Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHAMP1Q96JM3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHAMP1Q96JM3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms