Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELP4Q96EB1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms