Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF501Q96CX3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF501Q96CX3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms