Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms