Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NSUN4Q96CB9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NSUN4Q96CB9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms