Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNPO1Q92973 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms